55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0939 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  100 
 
 
449 aa  915    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  40.65 
 
 
468 aa  300  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  47.32 
 
 
266 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  46 
 
 
512 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  41.44 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  41.44 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  41.88 
 
 
381 aa  92  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  49.44 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40.34 
 
 
265 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40.34 
 
 
265 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  39.66 
 
 
266 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  43.59 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  42.11 
 
 
933 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.82 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.82 
 
 
619 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  36.61 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  36.61 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.82 
 
 
655 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  30.41 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  45.24 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  39.82 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.01 
 
 
574 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  33.04 
 
 
156 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  29.76 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  30.77 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.67 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  37.86 
 
 
157 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  35.64 
 
 
143 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  41 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  40.95 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  24.94 
 
 
474 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  34.11 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  33.66 
 
 
143 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  33.66 
 
 
143 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  40.35 
 
 
166 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  40.35 
 
 
166 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  24.73 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  36.28 
 
 
334 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  34.1 
 
 
255 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  34.1 
 
 
255 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  36.28 
 
 
334 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  31.08 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  35.64 
 
 
582 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  25.93 
 
 
446 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  65.71 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  36.15 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  36.15 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  39.25 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  39.25 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  32.14 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  37.65 
 
 
263 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  39.8 
 
 
279 aa  47  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  23.44 
 
 
464 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  33.12 
 
 
499 aa  46.2  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  29.67 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>