20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3502 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2130  CHAP domain-containing protein  53.15 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0066022  normal  0.0961309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3501  hypothetical protein  86.84 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0887  hypothetical protein  33.85 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0235973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2131  hypothetical protein  48.94 
 
 		 385 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000980684  normal  0.0372378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.35 
 
 		 655 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.66 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.66 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5979  CHAP domain-containing protein  43.75 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  37.21 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  35.53 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  35.16 
 
 		 157 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  37.93 
 
 		 512 aa  45.4  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5951  CHAP domain-containing protein  40.62 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  36.99 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.88 
 
 		 574 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  32.97 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  41.3 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  41.3 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  31.87 
 
 		 360 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>