16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2130 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2130  CHAP domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0066022  normal  0.0961309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  53.15 
 
 		 279 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0887  hypothetical protein  36.96 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0235973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2131  hypothetical protein  60.42 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000980684  normal  0.0372378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3501  hypothetical protein  54.17 
 
 		 344 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.14 
 
 		 655 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  32.14 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.46 
 
 		 619 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.46 
 
 		 619 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5979  CHAP domain-containing protein  40.91 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  37.89 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  37.89 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  42.03 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  29.87 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  29.87 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>