51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1070 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  100 
 
 		 468 aa  970    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  43.61 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  47.33 
 
 		 381 aa  118  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  44.37 
 
 		 318 aa  97.1  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  42.24 
 
 		 266 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.59 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  41.18 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  36.8 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  36.8 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  42.72 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.66 
 
 		 619 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.66 
 
 		 619 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  37.82 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  37.82 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  42.22 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  36.13 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  41.05 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  44.32 
 
 		 143 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.04 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  33.61 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  25.88 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  40.91 
 
 		 143 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  40.91 
 
 		 143 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  35.23 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  38.39 
 
 		 933 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  35.23 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  27.8 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  37.36 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  39.45 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  26.75 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  23.51 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  25.75 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  35.65 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  33.61 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  33.61 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  41.3 
 
 		 255 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  41.3 
 
 		 255 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  40.2 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  40.2 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  35.92 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  27.59 
 
 		 156 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  39.56 
 
 		 257 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  39.56 
 
 		 257 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  36.44 
 
 		 166 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  36.44 
 
 		 166 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  25.49 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  32.94 
 
 		 582 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2130  CHAP domain-containing protein  42.03 
 
 		 288 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0066022  normal  0.0961309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  38.27 
 
 		 279 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  37.88 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  22.3 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>