51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1683 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  100 
 
 
512 aa  1045    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  44.29 
 
 
303 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.75 
 
 
619 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.75 
 
 
619 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  46.53 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.13 
 
 
655 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
574 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  41.26 
 
 
390 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  45.1 
 
 
449 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  43.56 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  38.53 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  38.53 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  34.62 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  40.87 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.18 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  42.22 
 
 
468 aa  76.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  40.35 
 
 
933 aa  72.8  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  35.71 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  35.71 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  34.55 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  34.55 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  33.64 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  37.27 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  37.27 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  35.14 
 
 
157 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  35.38 
 
 
257 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  35.38 
 
 
257 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  40.78 
 
 
397 aa  60.1  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  31.53 
 
 
156 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  36.11 
 
 
143 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  33.63 
 
 
447 aa  57.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  32.84 
 
 
267 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  32.84 
 
 
267 aa  57.4  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  32.11 
 
 
143 aa  57  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  32.11 
 
 
143 aa  57  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  35.19 
 
 
255 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  35.19 
 
 
255 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  56.25 
 
 
360 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  35.16 
 
 
357 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  37.04 
 
 
166 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  37.04 
 
 
166 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  35.24 
 
 
359 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  38.82 
 
 
582 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  45.83 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  34.58 
 
 
169 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  33.91 
 
 
499 aa  47.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  33.7 
 
 
263 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  34.78 
 
 
455 aa  47.4  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  54.9 
 
 
231 aa  47  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  37.5 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  37.93 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>