More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2663 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  100 
 
 
464 aa  941    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  80.22 
 
 
474 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  32.31 
 
 
477 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.62 
 
 
462 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  33.74 
 
 
446 aa  183  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.73 
 
 
446 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  28.97 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  26.35 
 
 
441 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  45.74 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  26.76 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  46.38 
 
 
254 aa  120  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  28.47 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2767  Peptidase M23  30.6 
 
 
451 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.327973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  49.6 
 
 
253 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  25.96 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  27.7 
 
 
402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  24.72 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  46.09 
 
 
751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  48.8 
 
 
137 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.02 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45.67 
 
 
375 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.62 
 
 
411 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  49.6 
 
 
276 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  34.84 
 
 
456 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  46.32 
 
 
453 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  34.85 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.4 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  46.32 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.32 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  32.18 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  40.72 
 
 
824 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  48.78 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  42.45 
 
 
443 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40.43 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  32.4 
 
 
377 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  30.23 
 
 
391 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  34.04 
 
 
455 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.54 
 
 
442 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  39.72 
 
 
392 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.94 
 
 
377 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  40.62 
 
 
402 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  27.23 
 
 
446 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.53 
 
 
287 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  31.84 
 
 
454 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  41.94 
 
 
754 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.53 
 
 
321 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  42.19 
 
 
590 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  45.67 
 
 
301 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  43.75 
 
 
727 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  43.66 
 
 
318 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  43.75 
 
 
727 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  32.54 
 
 
375 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  30.56 
 
 
312 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.99 
 
 
430 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  24.62 
 
 
469 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  49.06 
 
 
333 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  30.54 
 
 
404 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  44.6 
 
 
487 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  44.53 
 
 
414 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  28.41 
 
 
447 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.46 
 
 
288 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  41.43 
 
 
648 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  28.41 
 
 
447 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  44.72 
 
 
398 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  40.85 
 
 
313 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44.72 
 
 
303 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.6 
 
 
524 aa  99.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  48.15 
 
 
216 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  40.16 
 
 
323 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  44.53 
 
 
198 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  41.43 
 
 
697 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  28.23 
 
 
300 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  40.46 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.44 
 
 
312 aa  98.6  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  41.43 
 
 
697 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.06 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.03 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  40.71 
 
 
699 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.75 
 
 
400 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.94 
 
 
274 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.41 
 
 
491 aa  97.8  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  40.12 
 
 
269 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  40 
 
 
695 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  43.75 
 
 
198 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  40.58 
 
 
676 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  40 
 
 
681 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.43 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.52 
 
 
387 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.57 
 
 
423 aa  97.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  43.17 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  30.15 
 
 
369 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45.67 
 
 
265 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  41.84 
 
 
646 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  40.31 
 
 
300 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.53 
 
 
238 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40.65 
 
 
527 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  41.48 
 
 
550 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  40.71 
 
 
645 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.43 
 
 
665 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  40 
 
 
683 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>