More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4454 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  100 
 
 
254 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  45.6 
 
 
276 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  53.71 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  61.19 
 
 
137 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  47.43 
 
 
445 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  45.7 
 
 
487 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  45.83 
 
 
474 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  46.46 
 
 
312 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.92 
 
 
303 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45.38 
 
 
375 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  43.09 
 
 
316 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  49.12 
 
 
640 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  46.38 
 
 
464 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  49.12 
 
 
640 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  39.35 
 
 
379 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.5 
 
 
282 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  39.2 
 
 
295 aa  102  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  43.55 
 
 
453 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  44.88 
 
 
457 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  46.61 
 
 
431 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.38 
 
 
376 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  46.77 
 
 
489 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.15 
 
 
455 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  46.43 
 
 
648 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  39.24 
 
 
330 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.74 
 
 
455 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.31 
 
 
402 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  45.76 
 
 
441 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.13 
 
 
456 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  42.5 
 
 
375 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  33.33 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  46.61 
 
 
538 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.86 
 
 
423 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  47.37 
 
 
646 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  42.15 
 
 
457 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  47.54 
 
 
695 aa  98.6  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  43.08 
 
 
345 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  45.16 
 
 
300 aa  98.6  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  43.22 
 
 
379 aa  98.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  41.32 
 
 
459 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  44 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  44.09 
 
 
454 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  31.34 
 
 
375 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  44 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  44 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.4 
 
 
430 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  43.08 
 
 
450 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  36.6 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  45.38 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  43.55 
 
 
413 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  38.41 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  45.08 
 
 
681 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  45.16 
 
 
446 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  36.99 
 
 
439 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  42.02 
 
 
448 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.92 
 
 
541 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  38.06 
 
 
399 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.34 
 
 
304 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  42.52 
 
 
412 aa  95.9  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  36.42 
 
 
299 aa  95.9  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  43.31 
 
 
477 aa  95.9  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38.06 
 
 
399 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.65 
 
 
442 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.09 
 
 
491 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  40.15 
 
 
440 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  44.44 
 
 
404 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  40.28 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.31 
 
 
462 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.32 
 
 
454 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  44.26 
 
 
676 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  45.08 
 
 
697 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  37.3 
 
 
299 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  46.72 
 
 
683 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  39.71 
 
 
414 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.44 
 
 
400 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  41.53 
 
 
334 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.09 
 
 
411 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  45.08 
 
 
697 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.61 
 
 
398 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  45.9 
 
 
699 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  41.18 
 
 
469 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.41 
 
 
404 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  46.49 
 
 
651 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  42.14 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  38.1 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  40 
 
 
369 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  44.92 
 
 
332 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  41.41 
 
 
482 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  41.18 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.62 
 
 
387 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42.86 
 
 
379 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  43.75 
 
 
442 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  43.7 
 
 
288 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  37.34 
 
 
327 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  37.98 
 
 
459 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  44 
 
 
645 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  38.89 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  38.1 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  38.1 
 
 
299 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  40.83 
 
 
384 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>