27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0478 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0478  surface antigen  100 
 
 
499 aa  959    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  67.73 
 
 
455 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  62.16 
 
 
447 aa  193  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  55.12 
 
 
169 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  34.33 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  43.21 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  43.01 
 
 
157 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  31.84 
 
 
279 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  31.84 
 
 
279 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  32.37 
 
 
933 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  29.61 
 
 
266 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  39.81 
 
 
266 aa  57  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  34.69 
 
 
143 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  34.69 
 
 
143 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  35.11 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  35.11 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  37.65 
 
 
143 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  33.61 
 
 
156 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  38.95 
 
 
265 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  38.95 
 
 
265 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0734  hypothetical protein  32.28 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000182503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  36.96 
 
 
324 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  37.96 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  37.96 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  39.81 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  39.81 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  37.29 
 
 
318 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>