44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2534 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  100 
 
 		 446 aa  883    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  50.77 
 
 		 434 aa  418  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  33.26 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  33.19 
 
 		 447 aa  134  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  25.91 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  24.5 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  33.85 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  27.01 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  25.5 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  23.81 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  24.94 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  24.62 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  22.82 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  23.2 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  24.58 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  24.17 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  22.66 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  22.57 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  21.95 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  21.95 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.38 
 
 		 574 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  21.95 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  22.43 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  21.46 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  23.08 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.03 
 
 		 655 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  22.74 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  19.33 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  21.54 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  23.1 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  23.24 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  37.63 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  31.25 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  37.63 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  31.25 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  37.5 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  22.78 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  20.1 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  23.32 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  22.63 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  24.68 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  22.63 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2199  aspartate protease family protein  27.37 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.312004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>