21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C65 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  100 
 
 		 434 aa  877    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  57.6 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  26.35 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  30.91 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  27.45 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  26.17 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  26.17 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  26.17 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  26.17 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  26.17 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  24.91 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  33.65 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  23.79 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  24.21 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  20 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  22.12 
 
 		 448 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  22.09 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  23.73 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  22.3 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  21.61 
 
 		 485 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>