49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1033 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  100 
 
 
390 aa  805    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  29.01 
 
 
933 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  45.08 
 
 
512 aa  106  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.94 
 
 
655 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.51 
 
 
574 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.59 
 
 
619 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.59 
 
 
619 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  49.44 
 
 
449 aa  90.1  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  48.31 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  45.08 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  47.19 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  31.62 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  41.05 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  38.95 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.32 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  38.2 
 
 
265 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  38.2 
 
 
265 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  33.6 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  33.6 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  39.56 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  37.8 
 
 
143 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  36.54 
 
 
357 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  39.36 
 
 
169 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  31.34 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  35.96 
 
 
156 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  37.08 
 
 
143 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  37.08 
 
 
143 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  34.69 
 
 
157 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  37.27 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  35.59 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  37.27 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  37.04 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  38.82 
 
 
582 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  39.34 
 
 
359 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  43.55 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  36.25 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.07 
 
 
2757 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  38.46 
 
 
499 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  33.04 
 
 
257 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  33.04 
 
 
257 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5886  hypothetical protein  37.66 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.174458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  36.47 
 
 
446 aa  43.9  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  30.17 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5669  hypothetical protein  36.84 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0126738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>