42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0398 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  100 
 
 		 381 aa  784    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  38.08 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  47.33 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  41.88 
 
 		 449 aa  90.9  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  48.28 
 
 		 482 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  42.98 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  42.98 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 619 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 619 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  48.31 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  43.1 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.69 
 
 		 655 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  38.58 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  34.07 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  34.07 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  34.62 
 
 		 512 aa  79.7  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  40.34 
 
 		 157 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.32 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  45.56 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.6 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  40.87 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  40.87 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  32.89 
 
 		 933 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  34.51 
 
 		 143 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  40.35 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  40.35 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  39.25 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  39.47 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  39.47 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  31.86 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  37.78 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  36.84 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  36.84 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  39.66 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  39.66 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  40.68 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  40.68 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  32.43 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  29.46 
 
 		 582 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>