More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0486 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  75.52 
 
 
324 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  47.52 
 
 
265 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  47.52 
 
 
265 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  46.31 
 
 
266 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  38.65 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  50.89 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  50.89 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  32.32 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  32.32 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.82 
 
 
338 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  50.47 
 
 
157 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  49.53 
 
 
156 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  37.38 
 
 
304 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  33.06 
 
 
266 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.59 
 
 
797 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  36.96 
 
 
499 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  33.18 
 
 
399 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  39.44 
 
 
267 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 
596 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.16 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  34.45 
 
 
440 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  33.16 
 
 
733 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.72 
 
 
840 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.4 
 
 
546 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 
444 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 
661 aa  92.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.52 
 
 
409 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.94 
 
 
255 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  38.97 
 
 
255 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  38.97 
 
 
255 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 
445 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 
544 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  47.66 
 
 
166 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  47.66 
 
 
166 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  40.31 
 
 
257 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  40.31 
 
 
257 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.08 
 
 
515 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  40.74 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  37.98 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.35 
 
 
534 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.27 
 
 
655 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  33.77 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  36.52 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  33.55 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  40.74 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  30.11 
 
 
695 aa  79.3  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  32.47 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  33.55 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.68 
 
 
554 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  32.72 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  31.82 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  31.82 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  31.82 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  30.47 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.18 
 
 
619 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  31.82 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.18 
 
 
619 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  31.84 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  28.79 
 
 
390 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  38.18 
 
 
512 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  39.55 
 
 
561 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  30.17 
 
 
539 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  32.47 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  38.52 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  28.34 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  29.95 
 
 
518 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.51 
 
 
579 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  39.25 
 
 
143 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  39.25 
 
 
143 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  33.77 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.2 
 
 
576 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  38.74 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.68 
 
 
568 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  26.13 
 
 
620 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.43 
 
 
617 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  29.53 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.1 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.91 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  33.72 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  36.81 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  30.46 
 
 
595 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  36.84 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.13 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  38.06 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  31.68 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  28.95 
 
 
495 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 
503 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.31 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  31.34 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 
527 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  26.9 
 
 
550 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  29.69 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  28.78 
 
 
849 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  27.5 
 
 
602 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>