More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2063 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
445 aa  843    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  59.89 
 
 
414 aa  364  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  49.19 
 
 
399 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  48.82 
 
 
440 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  51.62 
 
 
390 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  43.84 
 
 
390 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  36.96 
 
 
390 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  36.13 
 
 
499 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.71 
 
 
568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  25.1 
 
 
602 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  31.6 
 
 
661 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  38.89 
 
 
304 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.21 
 
 
1001 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  36.32 
 
 
544 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 
409 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.76 
 
 
1021 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.8 
 
 
617 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.78 
 
 
546 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.97 
 
 
515 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  33.91 
 
 
361 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 
620 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  32.97 
 
 
515 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 
515 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.87 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 
519 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  27.53 
 
 
1079 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  34.27 
 
 
547 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.62 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.97 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.63 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  33.68 
 
 
324 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
338 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  33.72 
 
 
495 aa  96.3  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  38.29 
 
 
527 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.28 
 
 
514 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.32 
 
 
515 aa  93.6  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  38.12 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.02 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
595 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  31.77 
 
 
733 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.86 
 
 
840 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.63 
 
 
470 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.87 
 
 
515 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  23.57 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 
539 aa  89.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.05 
 
 
612 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.73 
 
 
596 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 
612 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.52 
 
 
289 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  34.46 
 
 
334 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  34.46 
 
 
334 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  41.88 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
179 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  24.62 
 
 
509 aa  86.7  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  31.49 
 
 
511 aa  86.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  35.6 
 
 
587 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  32.63 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  35.08 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  30.06 
 
 
173 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  32.98 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.27 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.7 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  43.08 
 
 
301 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  39.13 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  28.02 
 
 
518 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.67 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.4 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.02 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.4 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 
517 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  39.34 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.02 
 
 
527 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.26 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  28.8 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  30.21 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 
580 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 
539 aa  76.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.66 
 
 
528 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 
263 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
204 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  27.87 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  34.44 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  30.28 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.32 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  30.85 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  26.92 
 
 
519 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  29.59 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  37.59 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  30.57 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  26.92 
 
 
519 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  30.14 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  30.32 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  29.41 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  31.33 
 
 
633 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  35.61 
 
 
204 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>