More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1211 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  100 
 
 		 338 aa  690    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  61.06 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  31.14 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  32.34 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.76 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  29.31 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 255 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.37 
 
 		 257 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  37.13 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  29.23 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  28.97 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  46.04 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  28.66 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.98 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.66 
 
 		 324 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  30.26 
 
 		 257 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  36.1 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.27 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.62 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  34.95 
 
 		 208 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.95 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.17 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  40.69 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.07 
 
 		 568 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  39.53 
 
 		 170 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  29.43 
 
 		 476 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  37.43 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  37.43 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 289 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0871  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 175 aa  95.5  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 205 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  44.35 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.29 
 
 		 150 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  34.25 
 
 		 171 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 		 190 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 		 190 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 		 190 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  38.13 
 
 		 246 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  36.21 
 
 		 274 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  39.57 
 
 		 246 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 		 147 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  40.16 
 
 		 147 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 156 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  37.31 
 
 		 458 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  39.84 
 
 		 205 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 189 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 210 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.01 
 
 		 150 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 		 189 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 193 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 536 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  47.87 
 
 		 267 aa  89.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  34.39 
 
 		 242 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.69 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 214 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 212 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 260 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 214 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  36.72 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 214 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 211 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  41.27 
 
 		 162 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 188 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 232 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  36 
 
 		 169 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  39.55 
 
 		 174 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 207 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.96 
 
 		 1048 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.55 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  37.93 
 
 		 205 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  33.54 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>