More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1956 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  59.73 
 
 		 298 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  66.41 
 
 		 178 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 424 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  33.62 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  37.44 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 575 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.14 
 
 		 577 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 418 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 216 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  30.36 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.86 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  29.39 
 
 		 579 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  29.29 
 
 		 341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 580 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  25.33 
 
 		 536 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  29.43 
 
 		 582 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  30.14 
 
 		 578 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  34.2 
 
 		 364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  50.82 
 
 		 150 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 532 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  30.31 
 
 		 582 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 232 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  29.75 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.72 
 
 		 420 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  28.72 
 
 		 420 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  27.85 
 
 		 598 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28.72 
 
 		 420 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  34 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  52.5 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  28.37 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.37 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  28.37 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  34.3 
 
 		 208 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.14 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  28.14 
 
 		 426 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.94 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.67 
 
 		 217 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.27 
 
 		 181 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  44.17 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  50 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  35.68 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  43.75 
 
 		 226 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  39.31 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  45.22 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  39.31 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.24 
 
 		 432 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  39.31 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  26.5 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.5 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 210 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 214 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 224 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  36.67 
 
 		 170 aa  99  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 207 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  37.72 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  42.37 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 476 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  35.76 
 
 		 169 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 342 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.13 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 342 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  37.42 
 
 		 203 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40 
 
 		 223 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 173 aa  96.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 346 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  39.52 
 
 		 234 aa  96.3  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  39.11 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  38.41 
 
 		 205 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.71 
 
 		 234 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.71 
 
 		 218 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.71 
 
 		 218 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.71 
 
 		 234 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.71 
 
 		 218 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.71 
 
 		 218 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  39.63 
 
 		 193 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>