More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2003 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  100 
 
 		 324 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  32.16 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  29.96 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  32.81 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  39.09 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  27.88 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  30.75 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  26.55 
 
 		 420 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.24 
 
 		 413 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  26.18 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.18 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  25.82 
 
 		 420 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  25.82 
 
 		 420 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  26.3 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  24.82 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  24.91 
 
 		 426 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  27.9 
 
 		 582 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  28.73 
 
 		 579 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  28.42 
 
 		 582 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  27.3 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 		 580 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  24.04 
 
 		 432 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  27.08 
 
 		 577 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  27.67 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  24.83 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  26.3 
 
 		 578 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  26.53 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  26.35 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  40 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.95 
 
 		 1049 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  44.57 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  24.01 
 
 		 536 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.38 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 969 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  26.73 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.02 
 
 		 1048 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  33.9 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  26.43 
 
 		 549 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  29.57 
 
 		 242 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  38.93 
 
 		 150 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.05 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  23.49 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.05 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  33.05 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  33.05 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  31.01 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  33.05 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  32.09 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  29.86 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39.62 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.75 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  34.35 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  24.2 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  32.2 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  32.2 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  32.2 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  36.72 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.3 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.3 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.3 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  27.71 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.3 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  42.86 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.3 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  35.9 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  36.54 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 234 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  38.26 
 
 		 225 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  30.83 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>