More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1562 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  100 
 
 		 553 aa  1105    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  91.74 
 
 		 549 aa  954    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.79 
 
 		 1049 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  31.67 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.07 
 
 		 969 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  34.63 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  31.42 
 
 		 582 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  33.15 
 
 		 564 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  33.15 
 
 		 564 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  33.15 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  30.6 
 
 		 582 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  32.87 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.18 
 
 		 580 aa  156  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  30.04 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.32 
 
 		 577 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  36.11 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  29.23 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  29.58 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  29.24 
 
 		 575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 		 553 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.33 
 
 		 413 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28.09 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.09 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  27.66 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  27.85 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.85 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.66 
 
 		 426 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  27.6 
 
 		 420 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  27.6 
 
 		 420 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  29.06 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  26.99 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  26.99 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 319 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  26.53 
 
 		 424 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.44 
 
 		 235 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.6 
 
 		 1776 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  25.45 
 
 		 341 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  31.94 
 
 		 388 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  50.55 
 
 		 293 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 306 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 296 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.14 
 
 		 332 aa  90.9  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 340 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  33.76 
 
 		 227 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  49.47 
 
 		 420 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.74 
 
 		 333 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 388 aa  87  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  50.67 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  49.47 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  36.23 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  46.59 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  30.82 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  51.28 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  27.38 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  45.12 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  32.24 
 
 		 1048 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.77 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  32.42 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  28.91 
 
 		 235 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  48.68 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  25 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  49.4 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.33 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.37 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  47.3 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.9 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  46.84 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  34.56 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  34.56 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.81 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  31.62 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 373 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  33.77 
 
 		 174 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  35.51 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.75 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  33.8 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  32.64 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  33.82 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  29.39 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  39.51 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  33.1 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.56 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  29.39 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 1284 aa  74.3  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  31.68 
 
 		 1067 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  43.02 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.98 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  32.7 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 380 aa  73.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>