More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2017 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  100 
 
 		 536 aa  1077    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  57.32 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  55.97 
 
 		 532 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  41.56 
 
 		 556 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  35.79 
 
 		 391 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  28.53 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.25 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.58 
 
 		 420 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  25.58 
 
 		 420 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  33.49 
 
 		 235 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  25.58 
 
 		 420 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  26.1 
 
 		 420 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  25.58 
 
 		 420 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  29.67 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  29.04 
 
 		 578 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  26.02 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  29.05 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  28.96 
 
 		 575 aa  120  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.33 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.13 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  25.13 
 
 		 426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.65 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  25.13 
 
 		 430 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  30.43 
 
 		 582 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  25.77 
 
 		 432 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.97 
 
 		 580 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.67 
 
 		 1048 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  30 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  29.29 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  30.1 
 
 		 582 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  47.97 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  28.75 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  28.03 
 
 		 598 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  25.08 
 
 		 296 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  47.24 
 
 		 181 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  26.03 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 216 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 150 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 265 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 255 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 188 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  43.55 
 
 		 188 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  35.4 
 
 		 275 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  30.84 
 
 		 271 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  35.4 
 
 		 271 aa  99  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 150 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  36.36 
 
 		 458 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  40.52 
 
 		 242 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 224 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  41.88 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 269 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 334 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  32.39 
 
 		 232 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.79 
 
 		 173 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 341 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 256 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 223 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.8 
 
 		 224 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 342 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.6 
 
 		 223 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 223 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 257 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  40.14 
 
 		 208 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  42.15 
 
 		 523 aa  94.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 223 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 223 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  39.84 
 
 		 222 aa  94  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 214 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  36.94 
 
 		 257 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 214 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 212 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 342 aa  93.6  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 269 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  38.89 
 
 		 273 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  40.8 
 
 		 342 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  38.89 
 
 		 273 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  44.17 
 
 		 333 aa  92.8  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  36.17 
 
 		 242 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  38.89 
 
 		 273 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  38.89 
 
 		 273 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  41.73 
 
 		 197 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  30.86 
 
 		 242 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 183 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  38.89 
 
 		 273 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 207 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 177 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 341 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  41.73 
 
 		 177 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 248 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 208 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 214 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>