More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3144 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  100 
 
 		 334 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  60.6 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.21 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.24 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  40.51 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  37.67 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.13 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.89 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  33.22 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  32.44 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.7 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  29.41 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  27.8 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48.67 
 
 		 162 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  30.04 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.7 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  34.08 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 160 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  31.35 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  29.79 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  26.95 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.23 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  50 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  28.14 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.55 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.86 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  25.29 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  29.88 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  30.93 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  27.19 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.7 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  28.94 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  24.38 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  24.38 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  24.38 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  29.58 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.88 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.07 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  26.83 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  25.91 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  26.88 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  32.18 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  32.18 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  28.69 
 
 		 375 aa  99.4  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 363 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  26.22 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 536 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  25.44 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 453 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 188 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.99 
 
 		 1048 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 452 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 204 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 432 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  41.51 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 391 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45 
 
 		 231 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.25 
 
 		 210 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  42.34 
 
 		 432 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.57 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 378 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  42.34 
 
 		 432 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  38.34 
 
 		 199 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  38.96 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.5 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  43.59 
 
 		 221 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.68 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  39.17 
 
 		 177 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  32.24 
 
 		 517 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  43.59 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.14 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 378 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  43.33 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  39.17 
 
 		 198 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.9 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 183 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  46.73 
 
 		 281 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.48 
 
 		 278 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.66 
 
 		 531 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 265 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>