More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0747 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  59.73 
 
 		 296 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  68.33 
 
 		 178 aa  178  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  31.79 
 
 		 424 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.97 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  32.02 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  28.36 
 
 		 577 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  28.2 
 
 		 532 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.2 
 
 		 532 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  26.87 
 
 		 582 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  26.57 
 
 		 578 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  26.03 
 
 		 536 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.75 
 
 		 150 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  28.77 
 
 		 556 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  38.1 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  26.87 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  27.51 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.87 
 
 		 580 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  27.47 
 
 		 579 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  27.31 
 
 		 582 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  27.04 
 
 		 582 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  41.13 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 183 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  30.22 
 
 		 364 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  40.48 
 
 		 198 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 188 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.48 
 
 		 177 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 208 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  38.36 
 
 		 207 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 150 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  40 
 
 		 203 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 224 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 168 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.69 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  25.68 
 
 		 598 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  34.1 
 
 		 209 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  43.59 
 
 		 221 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  37.58 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  34.1 
 
 		 209 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.72 
 
 		 193 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 223 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.22 
 
 		 223 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 223 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 208 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  42.4 
 
 		 226 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  39.23 
 
 		 242 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  42.37 
 
 		 224 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  41.53 
 
 		 218 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 218 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 218 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 218 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 234 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 234 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  34.16 
 
 		 223 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  41.53 
 
 		 234 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  34.16 
 
 		 223 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 179 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 207 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  39.06 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  27.55 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  41.06 
 
 		 205 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  29.76 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  37.7 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  38.74 
 
 		 166 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40.68 
 
 		 221 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  40.91 
 
 		 231 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 232 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  33.53 
 
 		 356 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  37.93 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  37.93 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  37.93 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  37.93 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  37.93 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.08 
 
 		 413 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  37.41 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  37.07 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  37.07 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  37.07 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>