More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2097 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  100 
 
 
341 aa  693    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  61.06 
 
 
338 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.46 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.97 
 
 
303 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.42 
 
 
255 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.58 
 
 
295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.21 
 
 
342 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.21 
 
 
342 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  30.49 
 
 
346 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  39.8 
 
 
216 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.14 
 
 
217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
257 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  34.43 
 
 
257 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  32.85 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  35.98 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  39.38 
 
 
324 aa  116  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.27 
 
 
342 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  37.56 
 
 
208 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.18 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.68 
 
 
265 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  32.4 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.47 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  50.42 
 
 
232 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.7 
 
 
285 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  46.15 
 
 
370 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  35.9 
 
 
208 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  50.83 
 
 
391 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  32.75 
 
 
289 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44 
 
 
424 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  38.98 
 
 
334 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.2 
 
 
289 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  38.98 
 
 
334 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  45.26 
 
 
150 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
190 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
190 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
190 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.76 
 
 
568 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
147 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 
147 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  44.63 
 
 
188 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
274 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  43.8 
 
 
189 aa  99.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  39.85 
 
 
333 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  31.05 
 
 
476 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
189 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.97 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  37.25 
 
 
191 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
235 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  36.17 
 
 
409 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
319 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  44.63 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  28.33 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  40 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  45.38 
 
 
150 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.95 
 
 
546 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
210 aa  92.8  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  41.32 
 
 
191 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  36.6 
 
 
242 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
188 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.74 
 
 
335 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  36.67 
 
 
536 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
211 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
450 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.75 
 
 
327 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  42.15 
 
 
191 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  38.41 
 
 
458 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  45.6 
 
 
188 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  43.44 
 
 
246 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
532 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  36.8 
 
 
170 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  40.31 
 
 
194 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  37.96 
 
 
171 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  37.91 
 
 
210 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  40.65 
 
 
532 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  40.31 
 
 
193 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.76 
 
 
205 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  42.64 
 
 
205 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  33.14 
 
 
203 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
193 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  40.18 
 
 
142 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
454 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
183 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.41 
 
 
207 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.27 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  39.68 
 
 
156 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
539 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  35.37 
 
 
231 aa  87.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
859 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>