More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0958 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  64.6 
 
 		 240 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  53.79 
 
 		 347 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  54.76 
 
 		 342 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  49.65 
 
 		 341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  56.67 
 
 		 342 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  53.39 
 
 		 246 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  54.17 
 
 		 342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  51.24 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  55.83 
 
 		 346 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 349 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  34.65 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  51.26 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 424 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  51.4 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 265 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  48.36 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  44.54 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.12 
 
 		 391 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 295 aa  98.6  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 319 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 301 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.74 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.8 
 
 		 370 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.96 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.96 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  47.83 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 		 325 aa  94.7  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.09 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  46.96 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 		 181 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  41.67 
 
 		 458 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 289 aa  92  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 333 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  43.9 
 
 		 1048 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.32 
 
 		 318 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 269 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  39.55 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 476 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 285 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 147 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 147 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 335 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 298 aa  89  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.18 
 
 		 368 aa  88.6  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  35.62 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 327 aa  87.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 220 aa  87.8  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 269 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  45.69 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  41.59 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  35.53 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.35 
 
 		 278 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  38.3 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  38.46 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>