143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1245 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  73.46 
 
 
1049 aa  1332    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  100 
 
 
969 aa  1930    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.32 
 
 
553 aa  174  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  34.24 
 
 
582 aa  162  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  32.16 
 
 
564 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  32.92 
 
 
582 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  31.92 
 
 
564 aa  155  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  31.92 
 
 
564 aa  155  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  31.92 
 
 
564 aa  155  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  36.8 
 
 
549 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  30.58 
 
 
577 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.17 
 
 
580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  30.84 
 
 
578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  33.17 
 
 
598 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  31.77 
 
 
582 aa  148  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  32.92 
 
 
579 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  34.9 
 
 
553 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  28.6 
 
 
575 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.65 
 
 
545 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  29.59 
 
 
564 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1467  putative enterotoxin  24.53 
 
 
947 aa  138  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0636  bifunctional autolysin  36.26 
 
 
1335 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000166594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.98 
 
 
1776 aa  127  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1266  putative enterotoxin  23.68 
 
 
956 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  27.9 
 
 
603 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  27.9 
 
 
603 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1112  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase., mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  37.26 
 
 
1248 aa  119  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00229916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.26 
 
 
1248 aa  119  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00817868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.74 
 
 
1284 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.2 
 
 
860 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0909  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  36.1 
 
 
632 aa  103  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0927  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  36.1 
 
 
632 aa  103  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0363  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  34.63 
 
 
624 aa  99  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0372  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  34.63 
 
 
624 aa  99  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1891  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.41 
 
 
258 aa  98.2  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  29.74 
 
 
430 aa  98.2  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  28.57 
 
 
384 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  27.54 
 
 
384 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  28.57 
 
 
384 aa  95.5  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  33.67 
 
 
386 aa  95.1  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.37 
 
 
386 aa  94.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  26.74 
 
 
420 aa  95.1  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  26.74 
 
 
420 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  33.67 
 
 
386 aa  95.1  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  26.01 
 
 
386 aa  95.1  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.74 
 
 
420 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  34.36 
 
 
341 aa  94.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  27.74 
 
 
418 aa  94.7  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.37 
 
 
386 aa  94  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  31.37 
 
 
386 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  26.37 
 
 
420 aa  93.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  31.37 
 
 
386 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  26.37 
 
 
420 aa  93.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2330  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.39 
 
 
258 aa  93.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2373  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.39 
 
 
258 aa  93.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.628854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  34.02 
 
 
383 aa  92  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.16 
 
 
426 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1330  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.04 
 
 
283 aa  91.7  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0937897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  26.75 
 
 
426 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  26.49 
 
 
413 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  27.16 
 
 
432 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  29.39 
 
 
424 aa  86.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1827  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  31.12 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1862  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  31.12 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  25.36 
 
 
1281 aa  84.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
296 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.64 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
907 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.67 
 
 
370 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.85 
 
 
616 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.1 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  33.76 
 
 
1067 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  26.86 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  19.14 
 
 
751 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  22.41 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  33.58 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  28.22 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  28.22 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  28.22 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  28.22 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  28.22 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  25.4 
 
 
297 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
298 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  31.25 
 
 
289 aa  66.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  28.37 
 
 
478 aa  66.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.27 
 
 
311 aa  64.7  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  64.7  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  26.8 
 
 
316 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.23 
 
 
414 aa  63.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  26.8 
 
 
310 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.23 
 
 
410 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  25.73 
 
 
469 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  27.74 
 
 
290 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  27.74 
 
 
294 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  27.74 
 
 
290 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  27.74 
 
 
290 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>