More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3022 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  52.92 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  32.57 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  40.3 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.24 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.24 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  31.63 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.88 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  34.39 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  32.99 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  34.89 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  34.3 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  31.43 
 
 		 338 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  35.98 
 
 		 208 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  30.47 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.26 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  32.87 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 216 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  32.49 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  44.04 
 
 		 458 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.73 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  35.21 
 
 		 208 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 246 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.19 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  26.17 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 424 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  31.74 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 232 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  33.94 
 
 		 269 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 164 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 193 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  33.94 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  36.81 
 
 		 169 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 208 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 476 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 202 aa  89.7  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 220 aa  89.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  38.51 
 
 		 173 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  44.64 
 
 		 190 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  44.64 
 
 		 190 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  39.01 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 211 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  44.64 
 
 		 190 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 174 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 188 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.55 
 
 		 1048 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  37.09 
 
 		 177 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  38.93 
 
 		 179 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  32.48 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 177 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 192 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  37.09 
 
 		 177 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  44.64 
 
 		 147 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 192 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  44.64 
 
 		 147 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.24 
 
 		 181 aa  86.7  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  35.39 
 
 		 181 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  43.14 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 184 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  36.69 
 
 		 225 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  33.33 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  42.19 
 
 		 174 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  31.25 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  31.25 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  31.25 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  39.09 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  38.18 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.5 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  35.4 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>