More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3603 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  50.85 
 
 
301 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  50 
 
 
342 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
346 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  38.33 
 
 
458 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  46.02 
 
 
208 aa  98.2  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  40.43 
 
 
342 aa  97.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  40.43 
 
 
342 aa  97.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  46.36 
 
 
341 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
289 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
391 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
265 aa  93.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
307 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  47.17 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  34.92 
 
 
257 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
202 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.48 
 
 
181 aa  91.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
232 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
257 aa  90.9  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  33.59 
 
 
298 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  46.36 
 
 
349 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
210 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  46.79 
 
 
246 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
278 aa  87.8  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  46.79 
 
 
347 aa  87.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
269 aa  87  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.84 
 
 
267 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
424 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
284 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  52.13 
 
 
318 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.87 
 
 
246 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.46 
 
 
217 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.29 
 
 
370 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  37.39 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
269 aa  85.5  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
240 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  37.68 
 
 
220 aa  85.5  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  36.52 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  35.54 
 
 
296 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  36.72 
 
 
295 aa  85.1  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  45.24 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  36.75 
 
 
319 aa  84.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  35.83 
 
 
170 aa  84  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  37.19 
 
 
255 aa  84  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  36.59 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.66 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
476 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
556 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  35.14 
 
 
266 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  37.09 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
285 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  46.94 
 
 
325 aa  81.3  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.81 
 
 
327 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  35.14 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
234 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  31.67 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
234 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  35.46 
 
 
201 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  43.86 
 
 
303 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.37 
 
 
234 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.37 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  41.44 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40.37 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
308 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
391 aa  77.8  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
223 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
223 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  37.82 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.45 
 
 
224 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  40.37 
 
 
223 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
223 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
221 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
536 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.45 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  38.21 
 
 
228 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  32.24 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  41.28 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  40.37 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.67 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  32.24 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  38.18 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  32.24 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  43.75 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  32.24 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  32.24 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>