More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1300 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  100 
 
 		 176 aa  357  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.86 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.11 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  43.23 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 301 aa  104  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  43.05 
 
 		 177 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  44.85 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  42.33 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  39.88 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  43.56 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  37.65 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  35.76 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  36.42 
 
 		 364 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  38.1 
 
 		 258 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 353 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  44.19 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  41.53 
 
 		 205 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  34.94 
 
 		 407 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  44.83 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  44.64 
 
 		 273 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 354 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  40.74 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 192 aa  98.2  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  37.42 
 
 		 404 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  36.65 
 
 		 248 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 289 aa  97.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  38.12 
 
 		 418 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1665  NLP/P60 protein  39.35 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 369 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 407 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  36.42 
 
 		 382 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.21 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 246 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 407 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 404 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  40.12 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  45 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  45.9 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  35.58 
 
 		 363 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.87 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  35.58 
 
 		 363 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  35.58 
 
 		 363 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  43.22 
 
 		 404 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  35.33 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  41.83 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  40.8 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  38.24 
 
 		 205 aa  94.4  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 249 aa  94.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  42.65 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  42.37 
 
 		 225 aa  94  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  42.65 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  33.77 
 
 		 221 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  38.64 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 220 aa  91.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  46.43 
 
 		 133 aa  91.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  43.48 
 
 		 198 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.48 
 
 		 177 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  42.48 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 240 aa  90.9  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  33.16 
 
 		 342 aa  90.9  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  45.37 
 
 		 303 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 333 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 278 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 242 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  37.24 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  33.16 
 
 		 342 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  43.97 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 215 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 208 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 208 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  41.38 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 221 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  37.5 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 223 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  37.2 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  41.28 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 223 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  34.92 
 
 		 223 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>