More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0199 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  59.76 
 
 		 233 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  57.48 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  50.41 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.31 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0124  NLP/P60 family protein  46.15 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.88 
 
 		 273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  47.58 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  44.37 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.66 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.66 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  47.54 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  39.08 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.96 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 325 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.07 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  44.6 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  41.1 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  44.29 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  45.04 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  39.87 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  41.56 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  37.72 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  39.38 
 
 		 154 aa  104  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  38.89 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  38.89 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  38.89 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  41.91 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  38.27 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  38.89 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 154 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  44.72 
 
 		 143 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 154 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  44.72 
 
 		 154 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  35.98 
 
 		 157 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 223 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  39.22 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  43.61 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.86 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  37.98 
 
 		 205 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.12 
 
 		 327 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  41.8 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  35.77 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  41.8 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.16 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.8 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  41.8 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  41.8 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  41.8 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  41.8 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  41.8 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  37.58 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  39.61 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 278 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.3 
 
 		 232 aa  98.6  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  38.27 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  38.27 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  38.27 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  38.27 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 269 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  38.27 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  41.94 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  40.17 
 
 		 275 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  41.94 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  37.18 
 
 		 267 aa  97.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  44.74 
 
 		 407 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  37.16 
 
 		 221 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  40.17 
 
 		 271 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.51 
 
 		 273 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  40.16 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.51 
 
 		 273 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  36.51 
 
 		 273 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  44.07 
 
 		 407 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  44.07 
 
 		 407 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  44.07 
 
 		 404 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  44.07 
 
 		 404 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  44.07 
 
 		 407 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>