More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 332 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  45.39 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  35.65 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  34.76 
 
 		 348 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  35.06 
 
 		 363 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  35.06 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  35.28 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  35.53 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  34.74 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  33.72 
 
 		 378 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  35.33 
 
 		 446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.26 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  37.94 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  35.47 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  34.22 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  33.02 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  53.51 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  54.78 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  31.3 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  32.14 
 
 		 394 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.41 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  55.56 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  61.46 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.03 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  47.46 
 
 		 452 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  32.7 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  33.22 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  47.37 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.19 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.82 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  56.12 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  30.17 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  39.89 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  33.64 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  52.48 
 
 		 236 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  30.67 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  50.86 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  55.43 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  50 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  49.04 
 
 		 162 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  50.96 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.57 
 
 		 531 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  29.61 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  52 
 
 		 370 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 517 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  42.36 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 535 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 432 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 859 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  47.78 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 476 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  48.21 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.03 
 
 		 210 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  37.79 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  38.75 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.4 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 256 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 188 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  49.51 
 
 		 400 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  48.15 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  43.9 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  50.52 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  45.22 
 
 		 170 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  49 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  48.25 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 160 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.36 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.87 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 168 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.74 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.21 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>