More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3579 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  100 
 
 		 323 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  80.5 
 
 		 323 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  37.42 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.44 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  33.65 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  34.52 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  32.9 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  34.66 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.94 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  32.49 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  34.03 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  33.22 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  31.1 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.88 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 453 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  28.94 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  27.05 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  26.91 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.97 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  45.95 
 
 		 417 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 236 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 349 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  44.23 
 
 		 432 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  36.78 
 
 		 394 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  27.36 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 162 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  44.23 
 
 		 432 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  29.97 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  28.3 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  49 
 
 		 459 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 374 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  29.12 
 
 		 363 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.23 
 
 		 235 aa  89.7  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  26.17 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  48.24 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  47.2 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 160 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.71 
 
 		 222 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.14 
 
 		 217 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 463 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  32.3 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.21 
 
 		 475 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  47.73 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  52.21 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.3 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 116 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  31.42 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  51.92 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  34.94 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.41 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  35.83 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  39.84 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  47.06 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  37.93 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  44.55 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.53 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  31.2 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  37.39 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.81 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  45.88 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  42 
 
 		 205 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.2 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  40.38 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  40.82 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>