More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8582 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  100 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  57.26 
 
 		 308 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  53.91 
 
 		 374 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  49.61 
 
 		 302 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  48.82 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  48.41 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  47.79 
 
 		 394 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.09 
 
 		 378 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  50.45 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  50.85 
 
 		 116 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.62 
 
 		 345 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 398 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 373 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 337 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.6 
 
 		 370 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.38 
 
 		 329 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  50 
 
 		 342 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.13 
 
 		 438 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.64 
 
 		 531 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 388 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  52 
 
 		 333 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.41 
 
 		 332 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 452 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.06 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 388 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.15 
 
 		 366 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 432 aa  98.6  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.38 
 
 		 210 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 347 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.34 
 
 		 337 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  41.86 
 
 		 275 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 375 aa  97.8  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  41.86 
 
 		 271 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.23 
 
 		 475 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.3 
 
 		 331 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 319 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  40 
 
 		 283 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 417 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 374 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 293 aa  95.1  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 374 aa  95.5  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 340 aa  95.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  48 
 
 		 269 aa  94.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 453 aa  95.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  40 
 
 		 283 aa  94.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  39.37 
 
 		 283 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  39.37 
 
 		 283 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.17 
 
 		 388 aa  94.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 501 aa  94.4  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 505 aa  94.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 517 aa  94.4  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 306 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 273 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 327 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 284 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  47.96 
 
 		 366 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  47.32 
 
 		 327 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 447 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 469 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 469 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 469 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 333 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 469 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  37.9 
 
 		 333 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  47 
 
 		 269 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  37.9 
 
 		 333 aa  91.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  37.9 
 
 		 333 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.8 
 
 		 349 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 463 aa  90.9  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 469 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 234 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.4 
 
 		 390 aa  90.5  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.67 
 
 		 340 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  38.68 
 
 		 467 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  40.29 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 467 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 467 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  39.84 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  39.84 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  42.96 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  37.1 
 
 		 333 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  51.76 
 
 		 335 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  37.9 
 
 		 333 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  39.84 
 
 		 269 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  44.9 
 
 		 404 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  46 
 
 		 278 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 348 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 432 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>