More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1561 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  100 
 
 		 337 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  49.64 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.88 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  50 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  48.36 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  52.63 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.97 
 
 		 162 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  45.52 
 
 		 432 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  49.07 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  49.07 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  43.86 
 
 		 467 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 467 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  47.22 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 467 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  46.73 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 478 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  43.61 
 
 		 458 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 469 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 469 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 625 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.52 
 
 		 321 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 472 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  41.27 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.74 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  44.86 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  41.21 
 
 		 182 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45.53 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.24 
 
 		 210 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 427 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 452 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  52.75 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.64 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.22 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 180 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  39.23 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.25 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 447 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 236 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 432 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  44.54 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  39.52 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  35.25 
 
 		 283 aa  86.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.15 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  35.25 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 388 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  32.58 
 
 		 267 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  34.55 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  52.69 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  39.69 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.27 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  36.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  36.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  35.62 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  36.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  36.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  36.17 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  30.62 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.25 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  35.62 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  43.43 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  39.44 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  34.59 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  37.07 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>