More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2140 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  100 
 
 		 427 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  35.75 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  63.77 
 
 		 505 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  63.77 
 
 		 475 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  63.77 
 
 		 475 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  63.77 
 
 		 475 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  62.22 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  60.87 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  62.22 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  61.59 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  60.74 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  62.22 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  62.22 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  60.74 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  61.48 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  61.48 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  57.25 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  58.7 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  58.7 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  57.78 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  57.97 
 
 		 256 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  57.97 
 
 		 256 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  60.87 
 
 		 225 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  60.14 
 
 		 257 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  60.14 
 
 		 257 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  60.14 
 
 		 257 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  57.25 
 
 		 248 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  59.42 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  59.42 
 
 		 256 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  58.7 
 
 		 248 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  56.52 
 
 		 253 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  55.8 
 
 		 164 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  52.94 
 
 		 230 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  54.41 
 
 		 228 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  51.45 
 
 		 241 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  51.45 
 
 		 241 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  51.45 
 
 		 221 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 239 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  48.48 
 
 		 625 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  49.63 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  42.18 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  29.62 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  38.29 
 
 		 214 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  37.79 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  37.79 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  37.79 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 208 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.98 
 
 		 337 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.07 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.73 
 
 		 531 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.62 
 
 		 340 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.67 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  40.28 
 
 		 495 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 350 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  36.73 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  40 
 
 		 204 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  36.03 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  39.34 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  32.14 
 
 		 1048 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  35.12 
 
 		 535 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.26 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  38.24 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.36 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  25.7 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  36 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.25 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.81 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  31.45 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  49.41 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.39 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  35.38 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  42.05 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.33 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.61 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.36 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  29.67 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  29.13 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  30.6 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.24 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>