More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1440 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  100 
 
 		 467 aa  944    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  71.13 
 
 		 469 aa  634    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  71.13 
 
 		 469 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  100 
 
 		 467 aa  944    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  72.52 
 
 		 469 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  70.91 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  71.34 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  71.76 
 
 		 467 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  63.21 
 
 		 472 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  52.74 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  58.45 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  58.45 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  58.45 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  54.6 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  51.92 
 
 		 479 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  62.8 
 
 		 256 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  62.8 
 
 		 256 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  60.39 
 
 		 248 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 256 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 256 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 256 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  60.39 
 
 		 248 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  61.17 
 
 		 225 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  61.35 
 
 		 256 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  55.77 
 
 		 241 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  55.77 
 
 		 241 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  55.77 
 
 		 221 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  52.48 
 
 		 239 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  56.07 
 
 		 253 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  52.63 
 
 		 230 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  51.21 
 
 		 228 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  60.24 
 
 		 164 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  60.42 
 
 		 505 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  60.9 
 
 		 427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  51.3 
 
 		 249 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  47.1 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  47.14 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 214 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 204 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  42.29 
 
 		 204 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  42.29 
 
 		 204 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 208 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.44 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.3 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.91 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.82 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 308 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.32 
 
 		 321 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 350 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 345 aa  90.9  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 370 aa  90.5  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  39.64 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  43.59 
 
 		 302 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 342 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.56 
 
 		 1048 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 180 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.59 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  36.88 
 
 		 273 aa  87.4  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  35.92 
 
 		 372 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 372 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 411 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 231 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 199 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  39.53 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  40 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.6 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  37.84 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  33.07 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  37.68 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  34.48 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 317 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  40 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  40 
 
 		 182 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.16 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>