More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2686 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  100 
 
 
330 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  54 
 
 
319 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.39 
 
 
306 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  33.44 
 
 
323 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  37.89 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  34.85 
 
 
340 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  37.3 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.83 
 
 
342 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  32.25 
 
 
340 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.87 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.23 
 
 
333 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.63 
 
 
323 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  32.21 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  30.92 
 
 
366 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30.79 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  53.12 
 
 
349 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  31.53 
 
 
323 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  35.86 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  30.1 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  29.84 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  31.15 
 
 
333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
162 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  50 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  31.7 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  50.44 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  25.52 
 
 
394 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.92 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  30.19 
 
 
375 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
301 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  33.44 
 
 
315 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.83 
 
 
210 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
453 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.23 
 
 
438 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.08 
 
 
332 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  49.59 
 
 
373 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
374 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.83 
 
 
531 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  39.83 
 
 
432 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  39.83 
 
 
432 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.28 
 
 
235 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
476 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  29.43 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
452 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.57 
 
 
388 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44 
 
 
524 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  45.76 
 
 
459 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
432 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  36.65 
 
 
501 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
374 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  45.76 
 
 
392 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.12 
 
 
400 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
398 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
535 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  30.54 
 
 
517 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
269 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43.16 
 
 
368 aa  89.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.97 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  27.07 
 
 
347 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  41.53 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
269 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  23.88 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.9 
 
 
150 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  47.31 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  37.71 
 
 
278 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
232 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.56 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.06 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
180 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  46 
 
 
669 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
370 aa  86.3  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.01 
 
 
150 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  36.89 
 
 
265 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  43.8 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.74 
 
 
204 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  44.8 
 
 
419 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.82 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  43.82 
 
 
197 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  39.32 
 
 
393 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  39.64 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  47.87 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  40.78 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.82 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>