More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7290 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  100 
 
 		 329 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  76.83 
 
 		 331 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  42.41 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  32.9 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  34.83 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  28.08 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.8 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  55.56 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.14 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  37.43 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  48.55 
 
 		 217 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.05 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  46.15 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  32.77 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.11 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 271 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 281 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  43.8 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.52 
 
 		 368 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.38 
 
 		 199 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  37.4 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.4 
 
 		 174 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4630  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 162 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  48.35 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  40 
 
 		 188 aa  89.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  47.25 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 437 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  51.19 
 
 		 162 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.88 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 173 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  45.22 
 
 		 176 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  51.19 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.31 
 
 		 235 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  44.35 
 
 		 175 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  39.69 
 
 		 217 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 215 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.43 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 206 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.35 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  52.33 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.84 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  41.53 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  38.35 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  45.28 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  43.55 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.18 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  41.91 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  41.6 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  39.68 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.76 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  45.54 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.69 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.27 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.65 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  32.82 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.95 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.94 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  42.4 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  44.35 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.52 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.9 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  49.52 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  49.43 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  54.32 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.27 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.06 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.31 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  30.91 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.57 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  41.23 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  40.94 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  49.43 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>