More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4630 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4630  NLP/P60 protein  100 
 
 
162 aa  322  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8932  NLP/P60 protein  53.1 
 
 
367 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00108547  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.69 
 
 
210 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
329 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.21 
 
 
308 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  37.06 
 
 
331 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  35.95 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.61 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  35.95 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.98 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
501 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.44 
 
 
321 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  37.41 
 
 
437 aa  77.4  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
342 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  38.46 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  36.69 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  36.24 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.98 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  42.11 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  36 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.12 
 
 
370 aa  74.3  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
392 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.8 
 
 
340 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.79 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.7 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  33.75 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.51 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  32.54 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  38.57 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  41.44 
 
 
302 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.38 
 
 
332 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  41.41 
 
 
364 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  37.21 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  35.4 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  34.17 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  34.56 
 
 
306 aa  71.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  36.75 
 
 
337 aa  70.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  39.83 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
432 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  34.59 
 
 
287 aa  70.5  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  34.59 
 
 
279 aa  70.5  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
354 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  37.6 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  32.34 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  39.84 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  34.38 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40.83 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  32.65 
 
 
553 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  37.09 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  36.43 
 
 
517 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.23 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.42 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
363 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40.62 
 
 
363 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
363 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.86 
 
 
330 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  34.92 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.05 
 
 
340 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  36.52 
 
 
334 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.07 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  36.72 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  35.94 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.65 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  32.65 
 
 
549 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  32.19 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  32.19 
 
 
269 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  38.94 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
394 aa  67.8  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
535 aa  67.8  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  32.19 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
367 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  32.19 
 
 
257 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.58 
 
 
303 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  44.92 
 
 
362 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  44.92 
 
 
362 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.589306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  32.19 
 
 
249 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  32.19 
 
 
234 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  32.19 
 
 
249 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  33.09 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.17 
 
 
347 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  39.06 
 
 
369 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.34 
 
 
1048 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  32.19 
 
 
269 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  34.13 
 
 
283 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>