More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1699 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 		 400 aa  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  49.15 
 
 		 293 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.74 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  43.09 
 
 		 197 aa  113  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.79 
 
 		 235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  52.59 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  37.58 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.97 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  41.67 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 349 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 452 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  48.08 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  48.08 
 
 		 281 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.04 
 
 		 332 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.18 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  49.06 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.86 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  49.06 
 
 		 330 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 306 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  48.54 
 
 		 466 aa  99.4  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 535 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  49.04 
 
 		 524 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  37.75 
 
 		 162 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 350 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 348 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.37 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 340 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.02 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  45.37 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  47 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.87 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.24 
 
 		 475 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 274 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  47.47 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 317 aa  93.2  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 476 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  36.08 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  48.21 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  44.33 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.32 
 
 		 330 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.9 
 
 		 531 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.62 
 
 		 347 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 256 aa  90.1  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 232 aa  89.7  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 301 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 236 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 347 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  39.1 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  52.94 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.93 
 
 		 340 aa  88.2  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.16 
 
 		 321 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.56 
 
 		 257 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 394 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  41.44 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.38 
 
 		 176 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 327 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 160 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  29.08 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.31 
 
 		 1048 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.64 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.35 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  39.52 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  43 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.55 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  32.73 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>