More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1816 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  100 
 
 		 330 aa  625  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  63.64 
 
 		 420 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  39.89 
 
 		 212 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.7 
 
 		 487 aa  96.3  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  34.51 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.4 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.55 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  44.54 
 
 		 349 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  46 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  38.52 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  37.5 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.79 
 
 		 1048 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 495 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 417 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  37.72 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.04 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.37 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  34.55 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  33.94 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36.5 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  31.6 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.34 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  29.25 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  33.16 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  41 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  29.65 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  33.72 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.15 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  34 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.19 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  40.19 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 480 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  34 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40.17 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  35.96 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.44 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  32.11 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  33.56 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.56 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  31.05 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  39.29 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  32.37 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  24.19 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  36.52 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  30.19 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  32.43 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  32.43 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  36.04 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  32.43 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  26.72 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  27.48 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.09 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  27.6 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>