More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  58.27 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  53.99 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  55.76 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  43.77 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  62.62 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  51.33 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.67 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  49.61 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 391 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.19 
 
 		 556 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.57 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  49.46 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 368 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  51.11 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  43.28 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  40.62 
 
 		 368 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  51.58 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  34.66 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 535 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.48 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 367 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  51.95 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  44.9 
 
 		 432 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  44.9 
 
 		 432 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 524 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.69 
 
 		 176 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.78 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  28.43 
 
 		 476 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  34.84 
 
 		 392 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 335 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.39 
 
 		 332 aa  88.6  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  38.79 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37.01 
 
 		 1048 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  39.67 
 
 		 197 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  38.41 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 349 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.72 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  38.38 
 
 		 333 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 417 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  38.38 
 
 		 333 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 168 aa  85.5  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 333 aa  85.5  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  39.72 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  45.35 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.43 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  37.37 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  40.82 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  36.36 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  36.36 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  36.36 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  36.36 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  44.57 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  36.36 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  39.5 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  43 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  36.36 
 
 		 333 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.81 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.86 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.57 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 178 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  37.91 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  47.13 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.05 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  43.3 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.12 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  43.96 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>