More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0399 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  48.18 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.15 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.62 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 391 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  38.51 
 
 		 370 aa  92.8  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  47.83 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.02 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 271 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  49.49 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 424 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.64 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.95 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  48.78 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.78 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.2 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  40.68 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  44.76 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  48 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.38 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  36.94 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  41.57 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.51 
 
 		 556 aa  75.5  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  36 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.57 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.68 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.07 
 
 		 1048 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.53 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.39 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 535 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  38.95 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  38.95 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 348 aa  72  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  42.05 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.71 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.94 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  40.91 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  38.38 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  38 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.94 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.33 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  44.32 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40.98 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  48.28 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  40.37 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.4 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  38.3 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  40 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  36.54 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  40 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  39 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  28.27 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 335 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  42.86 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  41.05 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>