More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0913 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  74.13 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  39.33 
 
 
259 aa  99  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.96 
 
 
313 aa  94.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.46 
 
 
332 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  48.04 
 
 
432 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.18 
 
 
333 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  48.04 
 
 
432 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.39 
 
 
319 aa  91.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  49.45 
 
 
391 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  40.57 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  45.36 
 
 
317 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.63 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.04 
 
 
370 aa  86.7  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  49.44 
 
 
257 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.86 
 
 
331 aa  85.1  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  47.17 
 
 
524 aa  84.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
476 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
256 aa  84.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  45.74 
 
 
265 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  50.59 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  49.38 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  38.4 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  49.38 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  47 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  38.4 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  49.38 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  35.71 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  48.78 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  43.96 
 
 
476 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  41.41 
 
 
418 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.7 
 
 
270 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  49.45 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  48.78 
 
 
372 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  48.78 
 
 
372 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
409 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.94 
 
 
335 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1016  NlpC/P60 family protein  38.74 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000775164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  47.78 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.44 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  48.39 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  40.4 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  41.75 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.74 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  47.56 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  45.35 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.57 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.51 
 
 
334 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.71 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
318 aa  78.2  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
859 aa  78.2  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.21 
 
 
366 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.55 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.19 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
325 aa  77  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  45.12 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  46.91 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.51 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  45.26 
 
 
582 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  48.05 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  43.33 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  35.04 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  38.52 
 
 
556 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  43.59 
 
 
454 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.94 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  33.88 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
575 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40.86 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  36.67 
 
 
532 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
348 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.46 
 
 
361 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
361 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  45.12 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  31.51 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  44.21 
 
 
577 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  39.17 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  42.17 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.05 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.59 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.3 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  42.68 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  45 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  42.68 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  44.05 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  42.68 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  42.68 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  43.75 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  46.74 
 
 
598 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>