More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2843 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  56.8 
 
 
259 aa  217  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  44.24 
 
 
256 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  51.92 
 
 
264 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
271 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.15 
 
 
261 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
257 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  43.61 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  33.47 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  35.4 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.74 
 
 
313 aa  85.5  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  39.17 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  37.28 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  51.32 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  37.32 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.5 
 
 
372 aa  79  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  30.77 
 
 
476 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  41.57 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.07 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  39.06 
 
 
536 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  39.22 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  39.22 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.45 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.69 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.76 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
532 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
532 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  44.94 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
297 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  34.97 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  35.38 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  36.92 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  35.07 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  43 
 
 
556 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  43.69 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.07 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.68 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  39 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  41.05 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  36.67 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.05 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  41.11 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  40 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  33.1 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  43.62 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37.27 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  41.49 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  41.84 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.58 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  38.18 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  31.98 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.74 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.16 
 
 
524 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  42.17 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  43.59 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  40.21 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.58 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  43.18 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  39.58 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  37.17 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  40.66 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.66 
 
 
438 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  40.82 
 
 
372 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  44.3 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.22 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  39.56 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.93 
 
 
523 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  36.9 
 
 
150 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  31.37 
 
 
205 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  36.56 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  40.16 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  33.62 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  40.59 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.97 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  39.81 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  43.53 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.23 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  37.19 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  39.6 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40 
 
 
1048 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  35.83 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  39.58 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  37.58 
 
 
192 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  47.5 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>