More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1266 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  100 
 
 
362 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  96.95 
 
 
362 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  96.95 
 
 
362 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  61.79 
 
 
368 aa  349  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  60.06 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  42.53 
 
 
384 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.33 
 
 
317 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  66.21 
 
 
392 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  65.07 
 
 
372 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  37.36 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.51 
 
 
535 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.01 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.53 
 
 
524 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
348 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.51 
 
 
556 aa  86.3  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
370 aa  85.9  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  45.1 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.16 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
162 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  45.65 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  47.25 
 
 
226 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.66 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.52 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  52.22 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  51.89 
 
 
182 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  39.26 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  45.92 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.01 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  47.19 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.35 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  48.89 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
204 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  44.66 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
183 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.92 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  40.46 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  35.56 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.3 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  34.38 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  36.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
234 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
234 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  36.61 
 
 
224 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.38 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  36.61 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  37.5 
 
 
234 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.5 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  39.05 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  38.18 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.56 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  35.71 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.85 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  38.71 
 
 
222 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.3 
 
 
224 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.73 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.16 
 
 
259 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.14 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.14 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  37.14 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  41.58 
 
 
177 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  38.28 
 
 
181 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  44.05 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
160 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  50 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.18 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  38.14 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.59 
 
 
1048 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  33.61 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
160 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.98 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  39.62 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.32 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  29.95 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  29.95 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  34.91 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  29.95 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.51 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  36.17 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  40.59 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  44.25 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  42.72 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.17 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  33.82 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  31.87 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  30.71 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>