More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4838 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  100 
 
 		 359 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  70.57 
 
 		 368 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  60.11 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  60.11 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  60.94 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  42.16 
 
 		 384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 317 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  68.18 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  66.41 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 535 aa  96.7  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  50.5 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.64 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  50 
 
 		 524 aa  85.9  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.87 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.42 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.94 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  39.5 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  45.12 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  39.5 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  44.86 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 164 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.89 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.47 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.2 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  43 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  43.88 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  45.05 
 
 		 226 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.7 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  53.93 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  34.15 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.54 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.71 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  37.88 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  41.84 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  41.84 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  44.71 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 453 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  40 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.86 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  39.69 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.97 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  41.58 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 223 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  39.42 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 223 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 183 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  36.17 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.82 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  35.71 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  35.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  35.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.68 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  40 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  45 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.36 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0045  NlpC/P60 family domain protein  34.65 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000018046  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.33 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>