More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4909 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  100 
 
 
335 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  43.3 
 
 
350 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.15 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  38.58 
 
 
348 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  31.69 
 
 
337 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  38.16 
 
 
337 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  37.66 
 
 
340 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  38.56 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.23 
 
 
333 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  33.24 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  33.24 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  33.24 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.33 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  32.72 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  32.8 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.78 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  31.91 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  30.79 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  32.05 
 
 
327 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  33.13 
 
 
323 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  50 
 
 
370 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  35 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  56.52 
 
 
331 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30.84 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  33.05 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  31.86 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  31.27 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  50 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  32.18 
 
 
348 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  34.29 
 
 
323 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  56.1 
 
 
417 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  54.95 
 
 
333 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.32 
 
 
217 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  39.09 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  39.88 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  47.62 
 
 
361 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  28.61 
 
 
432 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  47.62 
 
 
361 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  32.74 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  47.22 
 
 
363 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  29.81 
 
 
334 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  54.84 
 
 
380 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  49.23 
 
 
308 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
348 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.74 
 
 
362 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  51.35 
 
 
349 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  27.5 
 
 
432 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.04 
 
 
390 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
348 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
348 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.6 
 
 
232 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  47.42 
 
 
491 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.16 
 
 
265 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  53.16 
 
 
375 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
348 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  40.6 
 
 
335 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  57.47 
 
 
370 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  55.95 
 
 
256 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  47.22 
 
 
446 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  53.41 
 
 
315 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  38.38 
 
 
556 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
257 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  47.52 
 
 
293 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.22 
 
 
222 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  53.19 
 
 
257 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  46.88 
 
 
303 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  48.33 
 
 
392 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  48.46 
 
 
556 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  43.06 
 
 
476 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
298 aa  99.4  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.06 
 
 
176 aa  99.4  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.43 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 
327 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.43 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  43.75 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  43.75 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.79 
 
 
274 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  54.65 
 
 
162 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  42.16 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  49.07 
 
 
116 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.54 
 
 
1048 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  53.85 
 
 
392 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  43.75 
 
 
333 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
333 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  51.65 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  45.36 
 
 
502 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
432 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.65 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  55.81 
 
 
259 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  47.32 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.98 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  28.67 
 
 
301 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  45.54 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.899635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>