More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1820 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  100 
 
 		 330 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  53.94 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.62 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  30.11 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  27.78 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  27.5 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  28.84 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  31.55 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 348 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  30.65 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  29.72 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  30.65 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.41 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  31.53 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  29.48 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  29 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  26.26 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  32.7 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  32.7 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.97 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  29.3 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  29.62 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  50.47 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.94 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  36.55 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  29 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  30.13 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  28.38 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  28.77 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  27.24 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  30.18 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  28.39 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  26.73 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  25.97 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 173 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.88 
 
 		 235 aa  95.9  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  26.62 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  30.3 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.09 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 160 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  41.9 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.67 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  46.15 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  41.94 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  43 
 
 		 164 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 293 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 227 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 236 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  26.8 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  39.09 
 
 		 432 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.19 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.45 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.35 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  40 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  37.86 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34.96 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  34.4 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  39.45 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  37.61 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.63 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 476 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  45.12 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  31.4 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  47.76 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>