More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4498 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  100 
 
 		 398 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.85 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  53.64 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  50.44 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.54 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  56.07 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  42.03 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  53.27 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  50.76 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.64 
 
 		 475 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  51.72 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  47.57 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.54 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.61 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  46.49 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  36.05 
 
 		 524 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.66 
 
 		 222 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 236 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.76 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 347 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  48.98 
 
 		 366 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  58.82 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.79 
 
 		 162 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.84 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  42.15 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  43.02 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  39.71 
 
 		 625 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 535 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 204 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 180 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  47.15 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.94 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  28.24 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  27.16 
 
 		 306 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.18 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  35.67 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  31.66 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50.91 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.46 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  48 
 
 		 463 aa  99.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 350 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  27.2 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 232 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.62 
 
 		 176 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.16 
 
 		 556 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.69 
 
 		 531 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 333 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 333 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  40 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  45 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  39.2 
 
 		 197 aa  95.5  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 199 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0926  Tn916, NLP/P60 family protein  45.54 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.32 
 
 		 331 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  44.86 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  42.48 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  57.5 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44 
 
 		 330 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 232 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  36.8 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  27.97 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  48.08 
 
 		 495 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 190 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>