More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1461 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  100 
 
 		 366 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  72.13 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  51.22 
 
 		 326 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  45.9 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  44.96 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  44.12 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.86 
 
 		 176 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  46.96 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.85 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1612  NLP/P60  52.88 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.676409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50.45 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.87 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.94 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  48.51 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 162 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  46.09 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.31 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.95 
 
 		 459 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 236 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  55.68 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.48 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.09 
 
 		 308 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  46.53 
 
 		 180 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  52.81 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.22 
 
 		 393 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  47.12 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  46.02 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 501 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 517 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 204 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.76 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.52 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  46.6 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  51.65 
 
 		 487 aa  90.5  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  50.57 
 
 		 257 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  51.32 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.11 
 
 		 475 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 259 aa  86.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.34 
 
 		 531 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  46.3 
 
 		 302 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 256 aa  85.9  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  45 
 
 		 1048 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 173 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.3 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  39.39 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.46 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  45.37 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  39.53 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  36.61 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15430  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.46 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  34.76 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  46.59 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  43.41 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.83 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.83 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.83 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  42.2 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.12 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  41.67 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>