More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3453 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  100 
 
 
394 aa  785    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.16 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.74 
 
 
531 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.88 
 
 
321 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35.25 
 
 
342 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.77 
 
 
340 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  55.65 
 
 
417 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  32.45 
 
 
459 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  57.52 
 
 
345 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.45 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  31.45 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  49.22 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  31.34 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.13 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  47.54 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  34.58 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  50.86 
 
 
432 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  49.19 
 
 
331 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  50 
 
 
452 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  28.48 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  55.05 
 
 
375 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  48.11 
 
 
398 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.8 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  47.79 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  46.3 
 
 
315 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.67 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  49.6 
 
 
319 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
467 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  45.13 
 
 
469 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  43.36 
 
 
467 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
467 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
469 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.55 
 
 
438 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  44.25 
 
 
469 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.9 
 
 
491 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
337 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
333 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  48.65 
 
 
388 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  35.71 
 
 
231 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  43.36 
 
 
475 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
475 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
475 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
469 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
469 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
479 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
478 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
349 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.52 
 
 
330 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  42.2 
 
 
502 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.74 
 
 
475 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.9 
 
 
329 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  52.29 
 
 
362 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
236 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  47.5 
 
 
308 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  48.33 
 
 
501 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
505 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  47.71 
 
 
350 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  45.1 
 
 
422 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
162 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
472 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
378 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
335 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  46.27 
 
 
182 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
437 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  45.71 
 
 
372 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
372 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  28.18 
 
 
333 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  33.9 
 
 
517 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
372 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  39.57 
 
 
625 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.05 
 
 
388 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  27.92 
 
 
391 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
432 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
463 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  34.41 
 
 
348 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  45.31 
 
 
302 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.76 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  27.09 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  36.08 
 
 
199 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.36 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  45.38 
 
 
116 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
373 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  47.47 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.42 
 
 
368 aa  96.3  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.29 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.64 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  42.98 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.3 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  46.36 
 
 
281 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.26 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  38.39 
 
 
472 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  43.81 
 
 
367 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  39.67 
 
 
427 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>